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组蛋白修饰如何影响基因表达?

日期:2024-02-06 11:37:30

正如题为 "DNA压缩的强大伪装--组蛋白 "的文章所述,组蛋白修饰是对组蛋白进行的一系列翻译后修饰(PTM),包括甲基化、磷酸化、乙酰化、泛素化和苏木酰化。对组蛋白进行的 PTM 可通过改变染色质结构或招募组蛋白修饰因子来影响基因表达。但其机制仍不清楚。

在真核细胞的细胞核中,DNA缠绕在组蛋白的八聚体上形成核小体,其结构就像 "串珠",是染色质的基本单位。染色质进一步折叠成更高层次的结构,或松或紧,这有助于决定DNA的可及性。

两位科学家因其发现获得了2018年阿尔伯特-拉斯克基础医学研究奖,他们的发现阐明了基因表达如何受到组蛋白化学修饰的影响,组蛋白是染色体中包装DNA的蛋白质。

美国加州大学洛杉矶分校教授迈克尔-格伦斯坦(Michael Grunstein)通过在酵母中进行艰苦卓绝的遗传研究,证明了组蛋白对活细胞内基因活动的巨大影响,并为理解特定氨基酸在这一过程中的关键作用奠定了基础 [1]。洛克菲勒大学教授 C. David Allis 发现了一种能将特定化学基团连接到组蛋白中特定氨基酸上的酶,这种组蛋白修饰酶被证明是一种成熟的基因共激活因子,其生化功能一直困扰着研究人员 [2]。格伦斯坦和阿里斯揭开了基因控制的一个隐藏层次,开辟了一个新领域。

这里,我们以组蛋白乙酰化为例。如图 1 所示。通过组蛋白乙酰化激活转录,带有正电荷的乙酰赖氨酸可以使组蛋白与带有负电荷的 DNA 紧密结合。因此,转录机制无法访问 DNA,基因也就失去了活性。在组蛋白尾部的特定赖氨酸上添加乙酰基可以中和正电荷,松开核小体对 DNA 的控制。这一过程可使转录机制进入 DNA,从而使基因活跃起来。其他修饰以不同方式影响转录 [3] [4]

组蛋白乙酰化与基因表达的相关性

图1. 组蛋白乙酰化与基因表达的相关性

综上所述,对于组蛋白修饰与基因表达之间的相关性,有句话可以很好地描述这种关系:"转录调控是一个复杂而动态的过程,组蛋白修饰是其中的关键组成部分"。有些组蛋白修饰是活跃转录的结果;然而,这些组蛋白修饰提供了对近期转录活动的记忆,并为额外的转录调控提供了信号。许多组蛋白修饰与活跃转录无关,但在转录调控过程中发挥作用。全基因组实验、生物信息学分析以及可将表观遗传酶靶向特定 DNA 序列的新技术的快速发展,将有助于阐明无数组蛋白修饰的成因和生物学功能 [5]

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参考文献:

[1] Shahbazian, M.D., and Grunstein, M. Functions of site-specific histone acetylation and deacetylation [J]. Annu. Rev. Biochem. 2007, 76, 75-100.

[2] Lewis, P.W., Mueller, M.M., et al. Inhibition of PRC2 activity by gain-of-function mutations in pediatric gliobastoma [J]. Science. 2013, 340, 857-861.

[3] Kurdistani, S.K., Tavazoie, S, et al. Mapping global histone acetylation patterns to gene expression [J]. Cell. 2004, 117, 721-733.

[4] Maze, I., Noh, K.M., et al. Every amino acid matters: essential contributions of histone variants to mammalian development and disease [J]. Nat. Rev. Genet. 2014, 15, 259-271.

[5] Xianjun Dong and Zhiping Weng. The correlation between histone modifications and gene expression [J]. Epigenomics. 2013 Apr; 5(2): 113–116.