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SMN1基因蛋白过表达质粒构建实验流程

日期:2023-06-14 13:46:05


一、SMN1基因简介
 
    脊髓性肌萎缩症(spinal muscular atrophy,SMA)是一种常见的肌肉萎缩疾病,主要由于SMN1 (survival of motor neuron 1)基因的表达缺陷引起。SMN1基因编码一个名为survival of motor neuron (SMN)的蛋白,它是一个与细胞核中的前体RNA加工密切相关的蛋白。
 
    SMN蛋白含有一个高度保守的复合物,称为SMN复合物(SMN complex)。SMN复合物在RNA剪接和转录调控中发挥重要作用,并且在神经元运输过程中也扮演重要角色。SMN1基因突变或缺失导致SMN蛋白量大幅降低,从而导致SMA的发生。


smn1抗体

 
二、SMN1基因蛋白过表达质粒构建
 
1、实验设计
    通过构建含有SMN1基因的过表达质粒,将其转染到目标细胞中,实现SMN1抗体蛋白的过量表达。具体实验设计如下:
 
    (1)采用PCR技术从人类基因组DNA中扩增出SMN1全长序列。
 
    (2)构建SMN1基因的克隆体,插入到适合于目标细胞中表达的质粒载体中。为了方便检测和分选,可以将SMN1基因与荧光蛋白等标记基因连成一体。
 
    (3)将质粒DNA经过限制性内切酶切割和PCR检测后,纯化出大量的目的质粒。
 
    (4)将纯化得到的质粒DNA进行转染操作,转移到目标细胞内。
 
    (5)检测并验证SMN1蛋白过表达的效果,可以通过Western blot、免疫荧光等方式进行验证。
 
2、实验步骤

    (1)扩增SMN1基因全长序列
 
    使用人类基因组DNA作模板,设计引物扩增SMN1基因全长序列。选择引物时建议能够扩增出完整的SMN1序列,并且在5’端和3’端加入适当的限制性末端序列方便后续克隆处理。PCR反应方案如下:
 

成分 体积/重量
TAE buffer 10 ul
dNTPs (10 mM) 1 ul
Forward primer (10 uM) 0.5 ul
Reverse primer (10 uM) 0.5 ul
Template DNA 50 ng
Taq polymerase (5u/ul) 0.25 ul
ddH2O 100 ul
 
PCR条件如下:
 

步骤 温度 时间
初始变性 94°C 5 min
循环扩增
 
 
94°C 30 s
56°C 30 s
72°C 1 min/kbp
最终延伸 72°C 10 min
保持 4°C
 
    (2)构建SMN1基因的克隆体并插入质粒载体中
 
        将扩增出的SMN1基因与合适的质粒载体进行双酶切,并进行连接处理,得到含有SMN1全长序列的表达质粒。为了方便转染和检测,可以选择带有荧光标记的质粒载体(例如pEGFP-C1)。实验操作步骤如下:
 
        a. 双酶切
 
            将SMN1 PCR产物和质粒载体使用限制性内切酶进行双酶切,以便插入SMN1 DNA序列,其中使用的RE如下:
 
            SMN1:EcoRI和BamHI
            质粒载体:EcoRI和BamHI

        b. 连接
 
            将SMN1PCR产物和质粒载体使用T4 DNA ligase联接,形成含有SMN1基因的过表达质粒。
 
        c. 转染
 
            将得到的质粒DNA进行转染操作,转移到目标细胞中。
 
    (3)检测SMN1蛋白的过表达效果
 
            通过Western blot、免疫荧光等方式来检测SMN1蛋白的过表达效果。
 
            a. Western blot
 
                取适量的细胞,进行SDS-PAGE和电转印,然后进行Western blot分析。使用SMN1抗体和荧光二抗探测SMN1蛋白的表达程度。
 
            b. 免疫荧光
 
                选择合适的抗SMN1抗体和荧光二抗,利用荧光显微镜观察表达SMN1的细胞。
 
三、实验注意事项
 
    PCR反应条件需要根据引物设计和DNA模板质量进行优化,以获得高效率和特异性扩增产物。
 
    选取合适的质粒载体便于表达和检测,同时确保质粒对目标细胞有较高的转染效率。
 
   实验前充分准备好瓶盖、移液器、孵育箱等操作工具,并严格遵守无菌操作。
 
    转染处理时,要注意选取合适的转染试剂和转染条件,避免不必要的细胞毒性。
 
    在实验过程中要注意安全,避免接触实验物质及其溶液或制品,避免刺伤或感染。