SMN1基因蛋白过表达质粒构建实验流程
日期:2023-06-14 13:46:05
一、SMN1基因简介
脊髓性肌萎缩症(spinal muscular atrophy,SMA)是一种常见的肌肉萎缩疾病,主要由于SMN1 (survival of motor neuron 1)基因的表达缺陷引起。SMN1基因编码一个名为survival of motor neuron (SMN)的蛋白,它是一个与细胞核中的前体RNA加工密切相关的蛋白。
SMN蛋白含有一个高度保守的复合物,称为SMN复合物(SMN complex)。SMN复合物在RNA剪接和转录调控中发挥重要作用,并且在神经元运输过程中也扮演重要角色。SMN1基因突变或缺失导致SMN蛋白量大幅降低,从而导致SMA的发生。
二、SMN1基因蛋白过表达质粒构建
1、实验设计
通过构建含有SMN1基因的过表达质粒,将其转染到目标细胞中,实现SMN1抗体蛋白的过量表达。具体实验设计如下:
(1)采用PCR技术从人类基因组DNA中扩增出SMN1全长序列。
(2)构建SMN1基因的克隆体,插入到适合于目标细胞中表达的质粒载体中。为了方便检测和分选,可以将SMN1基因与荧光蛋白等标记基因连成一体。
(3)将质粒DNA经过限制性内切酶切割和PCR检测后,纯化出大量的目的质粒。
(4)将纯化得到的质粒DNA进行转染操作,转移到目标细胞内。
(5)检测并验证SMN1蛋白过表达的效果,可以通过Western blot、免疫荧光等方式进行验证。
2、实验步骤
(1)扩增SMN1基因全长序列
使用人类基因组DNA作模板,设计引物扩增SMN1基因全长序列。选择引物时建议能够扩增出完整的SMN1序列,并且在5’端和3’端加入适当的限制性末端序列方便后续克隆处理。PCR反应方案如下:
成分 | 体积/重量 |
TAE buffer | 10 ul |
dNTPs (10 mM) | 1 ul |
Forward primer (10 uM) | 0.5 ul |
Reverse primer (10 uM) | 0.5 ul |
Template DNA | 50 ng |
Taq polymerase (5u/ul) | 0.25 ul |
ddH2O | 100 ul |
PCR条件如下:
步骤 | 温度 | 时间 |
初始变性 | 94°C | 5 min |
循环扩增
|
94°C | 30 s |
56°C | 30 s | |
72°C | 1 min/kbp | |
最终延伸 | 72°C | 10 min |
保持 | 4°C | ∞ |
(2)构建SMN1基因的克隆体并插入质粒载体中
将扩增出的SMN1基因与合适的质粒载体进行双酶切,并进行连接处理,得到含有SMN1全长序列的表达质粒。为了方便转染和检测,可以选择带有荧光标记的质粒载体(例如pEGFP-C1)。实验操作步骤如下:
a. 双酶切
将SMN1 PCR产物和质粒载体使用限制性内切酶进行双酶切,以便插入SMN1 DNA序列,其中使用的RE如下:
SMN1:EcoRI和BamHI
质粒载体:EcoRI和BamHI
b. 连接
将SMN1PCR产物和质粒载体使用T4 DNA ligase联接,形成含有SMN1基因的过表达质粒。
c. 转染
将得到的质粒DNA进行转染操作,转移到目标细胞中。
(3)检测SMN1蛋白的过表达效果
通过Western blot、免疫荧光等方式来检测SMN1蛋白的过表达效果。
a. Western blot
取适量的细胞,进行SDS-PAGE和电转印,然后进行Western blot分析。使用SMN1抗体和荧光二抗探测SMN1蛋白的表达程度。
b. 免疫荧光
选择合适的抗SMN1抗体和荧光二抗,利用荧光显微镜观察表达SMN1的细胞。
三、实验注意事项
PCR反应条件需要根据引物设计和DNA模板质量进行优化,以获得高效率和特异性扩增产物。
选取合适的质粒载体便于表达和检测,同时确保质粒对目标细胞有较高的转染效率。
实验前充分准备好瓶盖、移液器、孵育箱等操作工具,并严格遵守无菌操作。
转染处理时,要注意选取合适的转染试剂和转染条件,避免不必要的细胞毒性。
在实验过程中要注意安全,避免接触实验物质及其溶液或制品,避免刺伤或感染。
上一篇: wb蛋白实验二抗的原理
下一篇: NINJ1诱导蛋白表达的载体是什么?