gapdh作为WB内参大小需要多少浓度的分离胶?
日期:2023-06-12 14:13:21
GAPDH(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)内源性蛋白质,在Western Blot(简称WB)实验中常被用作内参,以对待测蛋白的表达量进行校正。而WB实验中的分离胶浓度,通常由蛋白质的分子量和研究需要决定。
目前常用的SDS-PAGE体系,根据不同的要求一般有两种类型的分离胶:T分离胶和U分离胶。其中,T分离胶适用于分子量在10-250 kDa之间的蛋白质,而U分离胶适用于分子量在5-100 kDa之间的蛋白质。
针对您的问题,GAPDH的分子量约为36 kDa,因此在使用T分离胶的情况下,通常推荐将分离胶的浓度设定在10%-12、5%之间,以保证GAPDH能够充分地被分离并且呈现出较好的带状。而在使用U分离胶的情况下,通常建议将分离胶的浓度设定在12、5%以上,以确保GAPDH的带能够显著地与其它蛋白质的带进行区分。
以上的建议仅仅是一个参考值,实际的分离胶浓度还需要根据具体的实验目的和试验数据进行调整。此外,在WB实验中使用内参时,一定要注意它的表达水平和是否稳定,以避免误差的产生。
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